/etc/default/tomcat6 にある
AVA_OPTS="-Djava.awt.headless=true -Xmx128m -XX:+UseConcMarkSweepGC"
- Xmx128mという部分を,以下のように増やしたい分だけに書き換える
AVA_OPTS="-Djava.awt.headless=true -Xmx512m -XX:+UseConcMarkSweepGC"
Debian系では,/etc/init.d 以下にある起動スクリプトは,/etc/default 以下にある設定ファイルを読みに行くっぽい.